Мозаики нефа изображают сцены из Ветхого Завета, те, которые украшают пресбитерий, эпизоды из жизни Христа, а мозаики боковых нефов — сцены из жизни святых Петра и Павла. Самой красивой является наиболее древняя из всех мозаик Палатинской Капеллы — мозаика купола с изображением Христа Пантократора (Всемогущего) в окружении ангелов, архангелов и четырех евангелистов, которые погружены в медитацию.